Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx2P80206 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx2P80206 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx2P80206 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otx2P80206 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Otx2P80206 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx2P80206 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx2P80206 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx2P80206 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms