Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp8a1P70704 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp8a1P70704 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms