Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgif1P70284 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tgif1P70284 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms