Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb4bP68372 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tubb4bP68372 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms