Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rps27aP62983 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps27aP62983 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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