Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gnb1P62874 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms