Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tbpl1P62340 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tbpl1P62340 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms