Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm5P62322 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms