Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snrpd2P62317 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms