Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpeP62305 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpeP62305 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpeP62305 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpeP62305 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpeP62305 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpeP62305 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpeP62305 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpeP62305 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpeP62305 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpeP62305 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpeP62305 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpeP62305 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpeP62305 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpeP62305 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpeP62305 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpeP62305 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpeP62305 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpeP62305 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpeP62305 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpeP62305 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpeP62305 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpeP62305 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SnrpeP62305 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpeP62305 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpeP62305 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpeP62305 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpeP62305 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpeP62305 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpeP62305 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpeP62305 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpeP62305 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpeP62305 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpeP62305 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpeP62305 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpeP62305 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpeP62305 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SnrpeP62305 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpeP62305 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpeP62305 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpeP62305 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpeP62305 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpeP62305 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpeP62305 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpeP62305 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpeP62305 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpeP62305 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpeP62305 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpeP62305 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpeP62305 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpeP62305 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpeP62305 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpeP62305 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpeP62305 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpeP62305 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpeP62305 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpeP62305 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpeP62305 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpeP62305 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpeP62305 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpeP62305 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpeP62305 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpeP62305 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpeP62305 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpeP62305 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpeP62305 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpeP62305 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpeP62305 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpeP62305 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpeP62305 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpeP62305 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpeP62305 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpeP62305 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpeP62305 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpeP62305 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpeP62305 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpeP62305 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpeP62305 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpeP62305 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpeP62305 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms