Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps29P62274 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps29P62274 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps29P62274 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rps29P62274 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps29P62274 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps29P62274 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps29P62274 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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