Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms