Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ActbP60710 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ActbP60710 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ActbP60710 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ActbP60710 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ActbP60710 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ActbP60710 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ActbP60710 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ActbP60710 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ActbP60710 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ActbP60710 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ActbP60710 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ActbP60710 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ActbP60710 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ActbP60710 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ActbP60710 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ActbP60710 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ActbP60710 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ActbP60710 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ActbP60710 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ActbP60710 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ActbP60710 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ActbP60710 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ActbP60710 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ActbP60710 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ActbP60710 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ActbP60710 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ActbP60710 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ActbP60710 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ActbP60710 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ActbP60710 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ActbP60710 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ActbP60710 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ActbP60710 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ActbP60710 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ActbP60710 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ActbP60710 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ActbP60710 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ActbP60710 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ActbP60710 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ActbP60710 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ActbP60710 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ActbP60710 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ActbP60710 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ActbP60710 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ActbP60710 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ActbP60710 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ActbP60710 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ActbP60710 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ActbP60710 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ActbP60710 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ActbP60710 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ActbP60710 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ActbP60710 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ActbP60710 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ActbP60710 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ActbP60710 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ActbP60710 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ActbP60710 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ActbP60710 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms