Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ythdf1P59326 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ythdf1P59326 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ythdf1P59326 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ythdf1P59326 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ythdf1P59326 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ythdf1P59326 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ythdf1P59326 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ythdf1P59326 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ythdf1P59326 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ythdf1P59326 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ythdf1P59326 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ythdf1P59326 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ythdf1P59326 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ythdf1P59326 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ythdf1P59326 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ythdf1P59326 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ythdf1P59326 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ythdf1P59326 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ythdf1P59326 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms