Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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Ctdsp1P58466 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ctdsp1P58466 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ctdsp1P58466 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ctdsp1P58466 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Ctdsp1P58466 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdsp1P58466 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
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Ctdsp1P58466 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Ctdsp1P58466 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Ctdsp1P58466 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ctdsp1P58466 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ctdsp1P58466 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ctdsp1P58466 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ctdsp1P58466 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ctdsp1P58466 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ctdsp1P58466 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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