Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf5P56477 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf5P56477 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf5P56477 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf5P56477 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf5P56477 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf5P56477 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf5P56477 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf5P56477 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf5P56477 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf5P56477 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf5P56477 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf5P56477 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf5P56477 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf5P56477 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf5P56477 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf5P56477 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms