Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gp1bbP56400 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms