Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp1P55194 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
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Sh3bp1P55194 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp1P55194 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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