Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Efnb1P52795 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms