Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2e3P52483 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2e3P52483 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms