Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2e1P52482 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2e1P52482 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms