Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr1cP52432 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr1cP52432 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr1cP52432 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr1cP52432 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr1cP52432 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms