Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ClgnP52194 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ClgnP52194 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ClgnP52194 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ClgnP52194 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ClgnP52194 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClgnP52194 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClgnP52194 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms