Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apobec1P51908 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms