Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LumP51885 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LumP51885 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LumP51885 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LumP51885 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LumP51885 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LumP51885 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LumP51885 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LumP51885 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LumP51885 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LumP51885 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LumP51885 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LumP51885 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LumP51885 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LumP51885 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LumP51885 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LumP51885 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LumP51885 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LumP51885 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LumP51885 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LumP51885 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LumP51885 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LumP51885 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LumP51885 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LumP51885 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LumP51885 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LumP51885 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LumP51885 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LumP51885 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LumP51885 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LumP51885 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LumP51885 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LumP51885 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LumP51885 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LumP51885 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LumP51885 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LumP51885 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LumP51885 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LumP51885 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LumP51885 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LumP51885 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LumP51885 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LumP51885 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LumP51885 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LumP51885 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LumP51885 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LumP51885 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LumP51885 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LumP51885 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LumP51885 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LumP51885 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LumP51885 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LumP51885 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LumP51885 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LumP51885 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LumP51885 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LumP51885 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LumP51885 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LumP51885 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LumP51885 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LumP51885 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LumP51885 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LumP51885 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LumP51885 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LumP51885 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LumP51885 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LumP51885 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LumP51885 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LumP51885 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LumP51885 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LumP51885 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LumP51885 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LumP51885 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LumP51885 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LumP51885 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LumP51885 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LumP51885 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LumP51885 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LumP51885 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LumP51885 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LumP51885 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LumP51885 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LumP51885 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LumP51885 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LumP51885 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LumP51885 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LumP51885 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LumP51885 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LumP51885 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LumP51885 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LumP51885 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LumP51885 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LumP51885 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LumP51885 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LumP51885 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LumP51885 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LumP51885 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LumP51885 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LumP51885 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LumP51885 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms