Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FanccP50652 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FanccP50652 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FanccP50652 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FanccP50652 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FanccP50652 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FanccP50652 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FanccP50652 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FanccP50652 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FanccP50652 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FanccP50652 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FanccP50652 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FanccP50652 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FanccP50652 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FanccP50652 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FanccP50652 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FanccP50652 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FanccP50652 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FanccP50652 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FanccP50652 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FanccP50652 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FanccP50652 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FanccP50652 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FanccP50652 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FanccP50652 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FanccP50652 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FanccP50652 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FanccP50652 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanccP50652 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanccP50652 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanccP50652 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanccP50652 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanccP50652 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanccP50652 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanccP50652 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FanccP50652 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanccP50652 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanccP50652 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanccP50652 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FanccP50652 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanccP50652 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FanccP50652 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanccP50652 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FanccP50652 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FanccP50652 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanccP50652 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanccP50652 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanccP50652 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanccP50652 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanccP50652 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanccP50652 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanccP50652 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanccP50652 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanccP50652 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanccP50652 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanccP50652 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanccP50652 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanccP50652 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanccP50652 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanccP50652 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanccP50652 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanccP50652 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanccP50652 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanccP50652 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanccP50652 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanccP50652 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanccP50652 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanccP50652 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanccP50652 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanccP50652 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FanccP50652 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanccP50652 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanccP50652 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanccP50652 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanccP50652 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanccP50652 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanccP50652 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanccP50652 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanccP50652 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanccP50652 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanccP50652 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanccP50652 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanccP50652 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanccP50652 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanccP50652 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FanccP50652 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanccP50652 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanccP50652 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanccP50652 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanccP50652 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanccP50652 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanccP50652 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanccP50652 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanccP50652 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanccP50652 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanccP50652 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanccP50652 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanccP50652 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanccP50652 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanccP50652 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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