Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pa2g4P50580 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pa2g4P50580 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pa2g4P50580 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pa2g4P50580 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pa2g4P50580 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pa2g4P50580 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pa2g4P50580 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pa2g4P50580 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pa2g4P50580 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pa2g4P50580 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pa2g4P50580 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pa2g4P50580 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pa2g4P50580 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pa2g4P50580 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pa2g4P50580 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Pa2g4P50580 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pa2g4P50580 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms