Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdi1P50396 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdi1P50396 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdi1P50396 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdi1P50396 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdi1P50396 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdi1P50396 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdi1P50396 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdi1P50396 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdi1P50396 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdi1P50396 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdi1P50396 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdi1P50396 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdi1P50396 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdi1P50396 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdi1P50396 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms