Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl5P50228 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl5P50228 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cxcl5P50228 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxcl5P50228 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cxcl5P50228 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms