Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp9P49962 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp9P49962 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp9P49962 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp9P49962 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp9P49962 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms