Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VegfbP49766 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfbP49766 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfbP49766 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VegfbP49766 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VegfbP49766 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VegfbP49766 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfbP49766 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VegfbP49766 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfbP49766 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VegfbP49766 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms