Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnni3P48787 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnni3P48787 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3P48787 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3P48787 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3P48787 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3P48787 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3P48787 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3P48787 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3P48787 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3P48787 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3P48787 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3P48787 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnni3P48787 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnni3P48787 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms