Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ptx3P48759 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms