Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prox1P48437 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prox1P48437 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prox1P48437 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prox1P48437 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prox1P48437 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prox1P48437 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prox1P48437 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prox1P48437 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prox1P48437 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms