Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccl11P48298 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl11P48298 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms