Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brcc3P46737 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brcc3P46737 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms