Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ItgavP43406 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ItgavP43406 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgavP43406 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ItgavP43406 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ItgavP43406 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms