Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Elk1P41969 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Elk1P41969 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Elk1P41969 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Elk1P41969 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Elk1P41969 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Elk1P41969 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Elk1P41969 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Elk1P41969 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Elk1P41969 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Elk1P41969 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Elk1P41969 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Elk1P41969 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Elk1P41969 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms