Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf9P41274 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfsf9P41274 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms