Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik2P39087 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik2P39087 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik2P39087 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik2P39087 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grik2P39087 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grik2P39087 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik2P39087 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik2P39087 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik2P39087 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik2P39087 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik2P39087 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik2P39087 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik2P39087 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms