Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PtprkP35822 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PtprkP35822 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PtprkP35822 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprkP35822 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprkP35822 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PtprkP35822 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprkP35822 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtprkP35822 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PtprkP35822 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
PtprkP35822 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PtprkP35822 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtprkP35822 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtprkP35822 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms