Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd22P35329 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd22P35329 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd22P35329 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd22P35329 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd22P35329 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd22P35329 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cd22P35329 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms