Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd1P33215 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd1P33215 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms