Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SsbP32067 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SsbP32067 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SsbP32067 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SsbP32067 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SsbP32067 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SsbP32067 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SsbP32067 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SsbP32067 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SsbP32067 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SsbP32067 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SsbP32067 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SsbP32067 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SsbP32067 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SsbP32067 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SsbP32067 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SsbP32067 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SsbP32067 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SsbP32067 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SsbP32067 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SsbP32067 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SsbP32067 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SsbP32067 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SsbP32067 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SsbP32067 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SsbP32067 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SsbP32067 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SsbP32067 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SsbP32067 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SsbP32067 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SsbP32067 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SsbP32067 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SsbP32067 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SsbP32067 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SsbP32067 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SsbP32067 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SsbP32067 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SsbP32067 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SsbP32067 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SsbP32067 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SsbP32067 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SsbP32067 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SsbP32067 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SsbP32067 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SsbP32067 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SsbP32067 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SsbP32067 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SsbP32067 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SsbP32067 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SsbP32067 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SsbP32067 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SsbP32067 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SsbP32067 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SsbP32067 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SsbP32067 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SsbP32067 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SsbP32067 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SsbP32067 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SsbP32067 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SsbP32067 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SsbP32067 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SsbP32067 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SsbP32067 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SsbP32067 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SsbP32067 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SsbP32067 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SsbP32067 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SsbP32067 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SsbP32067 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SsbP32067 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SsbP32067 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SsbP32067 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SsbP32067 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SsbP32067 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SsbP32067 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SsbP32067 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SsbP32067 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SsbP32067 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms