Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Notch4P31695 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Notch4P31695 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Notch4P31695 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Notch4P31695 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Notch4P31695 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Notch4P31695 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Notch4P31695 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Notch4P31695 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Notch4P31695 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Notch4P31695 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Notch4P31695 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Notch4P31695 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Notch4P31695 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Notch4P31695 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Notch4P31695 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Notch4P31695 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Notch4P31695 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Notch4P31695 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms