Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms