Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VtnP29788 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VtnP29788 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VtnP29788 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VtnP29788 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VtnP29788 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VtnP29788 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VtnP29788 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VtnP29788 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VtnP29788 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VtnP29788 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VtnP29788 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VtnP29788 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VtnP29788 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VtnP29788 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VtnP29788 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VtnP29788 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VtnP29788 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VtnP29788 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VtnP29788 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VtnP29788 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VtnP29788 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VtnP29788 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VtnP29788 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VtnP29788 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VtnP29788 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VtnP29788 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VtnP29788 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VtnP29788 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VtnP29788 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VtnP29788 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VtnP29788 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VtnP29788 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VtnP29788 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VtnP29788 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VtnP29788 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VtnP29788 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VtnP29788 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VtnP29788 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VtnP29788 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VtnP29788 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VtnP29788 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VtnP29788 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VtnP29788 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VtnP29788 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VtnP29788 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VtnP29788 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VtnP29788 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VtnP29788 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VtnP29788 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VtnP29788 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VtnP29788 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VtnP29788 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VtnP29788 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VtnP29788 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VtnP29788 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VtnP29788 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VtnP29788 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VtnP29788 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VtnP29788 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VtnP29788 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VtnP29788 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VtnP29788 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VtnP29788 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VtnP29788 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VtnP29788 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VtnP29788 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VtnP29788 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VtnP29788 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VtnP29788 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VtnP29788 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VtnP29788 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VtnP29788 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VtnP29788 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VtnP29788 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VtnP29788 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VtnP29788 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VtnP29788 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VtnP29788 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VtnP29788 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VtnP29788 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms