Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tgfb2P27090 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfb2P27090 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tgfb2P27090 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tgfb2P27090 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tgfb2P27090 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgfb2P27090 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms