Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctnna1P26231 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms