Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb7P26011 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itgb7P26011 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms